Nas décadas de 80 e 90, cresceram em Santa Catarina as preocupações com a poluição dos recursos hídricos e seu uso indiscriminado pelos setores industriais. O órgão ambiental do Governo de Santa Catarina, a Fundação do Meio Ambiente (FATMA), para aperfeiçoar seus conhecimentos tecnológicos e científicos, buscou ajuda na Alemanha, um dos países mais avançados em metodologias para gestão dos recursos hídricos.

Capacitar o corpo técnico e instrumentalizar a FATMA para atuar em todo Estado.
Desenvolver metodologias e instrumentalização da Fundação para o gerenciamento dos recursos hídricos e controle da poluição industrial.
Selecionou-se o Complexo Hídrico da Baía da Babitonga, em Joinville, maior pólo industrial do Estado, como área piloto para sua implementação.

A realização das ações previstas no Projeto FATMA/GTZ criará as condições necessárias para que o Estado, através de suas instituições, notadamente a Secretaria do Desenvolvimento Urbano e Meio Ambiente (SDM) e a FATMA, implante sua política de Recursos Hídricos, considerando-se as bases legais existentes e os instrumentos que a compõem.

O projeto FATMA/GTZ tem como premissa a busca permanente de parcerias e sua consolidação. Desde o início, estabeleceu-se a cooperação com a Prefeitura Municipal de Joinville, através da Fundação Municipal do Meio Ambiente (FUNDEMA), Universidades (UDESC e UNIVILLE), Associação Comercial e Industrial de Joinville (ACIJ) e outras instituições.

O projeto, na sua área de atuação, tem procurado auxiliar tanto o setor público quanto o setor privado na busca de soluções para seus problemas, através da contratação de peritos nacionais e internacionais.

De março de 1994 a outubro de 1997, o Projeto FATMA/GTZ viabilizou 34 treinamentos, cursos e seminários, com mais de 1.100 participações. Entre eles o Seminário BRASIL-ALEMANHA sobre a Importância da Cooperação Intermunicipal no Gerenciamento de Recursos Hídricos e Resíduos Sólidos, realizado em Abril 1997 em Florianópolis, Joinville e Joaçaba.

Recursos do Projeto FATMA/GTZ foram alocados para a melhoria do sistema de informatização da FATMA, através da elaboração e instalação de softwares e redes de computadores, treinamento do corpo técnico em informática e aquisição de equipamentos.

Com a informatização, implantou-se um banco de dados que centralizou as informações do processo de licenciamento ambiental, anteriormente dispersas entre vários setores e em inúmeras versões.

Desenvolveu-se o Cadastro Industrial, que objetiva atualizar os dados das indústrias catarinenses, com a formação de banco de dados que subsidiará a implantação da Política Estadual de Recursos Hídricos. O Cadastro Industrial reúne informações sobre dados de produção, captação e uso da água, sistemas de tratamento, resíduos sólidos, entre outros.

O Projeto FATMA/GTZ elaborou ainda o Sistema de Automonitoramento, onde as próprias empresas que geram efluentes farão a coleta, medição e análise de seus resíduos líquidos, tudo alicerçado em critérios técnicos e metodológicos definidos pela FATMA. A caracterização dos efluentes líquidos lançados nos corpos receptores auxiliará a gestão dos sistemas de tratamento e de recursos hídricos.

Em janeiro de 1997, o Projeto FATMA/GTZ deu início às operações do primeiro laboratório de Ecotoxicologia de Santa Catarina, em Florianópolis. Controla-se a toxidade dos recursos hídricos e efluentes através de bioindicadores – organismos vivos como algas, fotobactérias, microcrustáceos e peixes.

Com os testes ecotoxicológicos, também chamados bio-ensaios, mede-se o efeito de substâncias individuais ou de misturas de substâncias (p.ex.efluentes) nos organismos. Em princípio os efeitos só podem ser identificados por matéria viva. A comprovação dos efeitos por meio da análise química não é possível.

Em maio de 1997, o Projeto FATMA/GTZ inaugurou no campus da Universidade para o Desenvolvimento do Estado de Santa Catarina (UDESC), em Joinville, um laboratório físico-químico e bacteriológico. Realiza-se análises de efluentes industriais e dos rios da região, com o objetivo de verificar o tipo e grau de poluição, além de verificar se há contaminação por coliformes fecais.

Como auxílio e complemento à implantação de um sistema de gerenciamento de recursos hídricos, o Projeto FATMA/GTZ, em sua área piloto, implantou três estações hidrometeorológicas que coletam dados sobre o regime hidráulico e meteorológico nas bacias contribuintes da Baía de Babitonga. Os dados permitem calcular a disponibilidade de água na região para uso em geral (doméstico, industrial, agricultura, etc.), fornecendo ainda informações imprescindíveis para a implantação do Direito de Outorga do Uso do Recurso Hídrico, instrumento previsto na Lei Estadual e Federal de Recursos Hídricos.